Q1. Je souhaite mettre en place une solution informatique de traçabilité dans mon laboratoire. Comment procéder ?

La première étape à réaliser est d'écrire un dossier d'expression du besoin. Il s'agit d'un document décrivant les fonctionnalités métier attendues par la solution à mettre en place (sorte de cahier des charges).

Nous avons mis au point une trame permettant de poser l'ensemble des questions menant à la conception de ce document.

N'hésitez pas à nous demander ce document par email : demandez la trame.

Q2. Dois-je acheter à Sibio une prestation d'adaptation du logiciel pour qu'il soit utilisable ?

Ce n'est pas forcément nécessaire. SibioCLE, grâce à son interface graphique, est facilement adaptable et peut même être étendu via son système de plug-ins sans intervention de notre part.

Néanmoins dans le cadre d'une plateforme fonctionnelle et pour obtenir contractuellement un système efficace, la prestation d'intégration est un gage de réussite.

Q3. Comment est réalisée la connexion entre SibioCLE et les matériels scientifiques ?

L'architecture de SibioCLE intègre un module de plug-ins qui permet d'interfacer la plupart des automates de laboratoire (robots pipeteurs, TaqMan, séquenceurs, spectrométrie de masse, ...) ainsi que des traitements spécifiques à la demande. Chaque plug-in est écrit en langage Python et fonctionne grâce à un flux XML.

La réalisation de ces plug-ins est envisageable de deux manières :

• l'équipe de déveleppement de Sibio peut les réaliser pour vous
• vous les réalisez vous-même, avec un peu de connaissances en Python (ou après une formation que nous pouvons vous dispenser dans ce langage)

Q4. Quels sont les avantages de l'infrastructure de plug-in ?

L'interfaçage de SibioCLE avec les appareils scientifiques ne nécessite qu'un développement rapide, à faible coût, et ne touche pas à la base de données de SibioCLE.

De plus si vous possédez des compétences informatiques en interne, vous serez libres de faire évoluer le logiciel selon vos besoins.

Q5. Comment interfacer SibioCLE avec mes logiciels scientifiques ?

De la même façon à l'aide du module de plug-ins, il est tout à fait possible de communiquer avec la plupart des logiciels scientifiques et/ou de gestion.

Q6. Peut-on produire avec SibioCLE des factures lorsque le laboratoire réalise des prestations de services scientifiques ?

SibioCLE génère les éléments utiles pour produire une facture liée à une prestation de services (temps passé, quantité de consommables utilisés, coût d'utilisation des matériels scientifiques).

Un package d'échange avec des ERP permet de transférer ces informations pour créer ensuite la facture sur l'outil de comptabilité. Ce package est aujourd'hui proposé pour la solution SAGE.

Q7. Les composants libres au niveau de la base de données ou du serveur d'application sont-ils de moins bonne qualité que des composants propriétaires ? Pourquoi choisir l'un ou l'autre ?

Il y a en informatique deux communautés d'utilisateurs : il y a ceux qui ne travaillent qu'avec des composants libres et ceux qui ne travaillent qu'avec des produits propriétaires.

Notre application SibioCLE fonctionne sous Java et répond aux attentes de ces deux communautés :

• pour le monde libre : PostgreSQL + Tomcat

• pour le monde propriétaire : Oracle + Tomcat

Q8. Qu’est ce qu'un cahier de laboratoire papier ou électronique ?

Nous trouvons très intéressante l'étude menée par Christine Culot pour les Facultés Universitaires Notre-Dame de la Paix de Namur sur les cahiers de laboratoire. Cette présentation porte à la fois sur les cahiers de laboratoire papiers et les cahiers de laboratoire électroniques tels que SibioCLE.

Télécharger la présentation.

Q9. Pourquoi tenir un cahier de laboratoire papier ou électronique ?

1. permettre la bonne réalisation de la recherche et garantir la traçabilité des expériences;
2. témoigner de la date d'obtention des résultats (en cas de litige ou dans le cadre d'une procédure de dépôt de brevet, le cahier constitue un élément de référence);
3. éviter la perte de données;
4. capitaliser le savoir du laboratoire et faciliter la transmission des connaissances en interne et/ou faciliter le transfert de technologies;
5. s'adapter aux exigences de la recherche internationale et professionnaliser les pratiques liées à la recherche.

Q10. Pourquoi mettre en place un système de traçabilité dans mon laboratoire ?

Nous vous invitons à consulter la présentation (Etude de cas) du Dr. P. Zaborski, responsable de l'assurance Qualité et du partenariat de Genexpress, une équipe de génomique fonctionnelle dont l'expérimentation s'articule autour d'une plateforme microarray, au sein de l'unité mixte UMR 7091 CNRS/Université P. et M. Curie.

Télécharger la présentation.

Q11. Comment intégrer le Programme SSP (SibioCLE Solutions Partenaires) ?

Vous êtes une société de bioinformatique, vous avez mis au point une solution qui pourrait interagir avec le logiciel SibioCLE : contactez-nous et nous vous transmettrons les protocoles d'échanges entre votre application et l'infrastructure de communication de SibioCLE.

Q12 : SibioCLE fonctionne-t-il sur un ordinateur Mac ?

SibioCLE fonctionne à la fois sur PC / Linux / Mac.

Vous trouverez sur la page Technologie notre matrice de compatibilité.